Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGISQ16647 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
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