Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA6Q15825 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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