Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
RABEP1Q15276 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
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