Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRD3Q15059 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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