Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN5AQ14524 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN5AQ14524 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN5AQ14524 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms