Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP3B2Q13367 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP3B2Q13367 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP3B2Q13367 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP3B2Q13367 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3B2Q13367 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3B2Q13367 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3B2Q13367 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3B2Q13367 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3B2Q13367 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3B2Q13367 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3B2Q13367 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3B2Q13367 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3B2Q13367 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3B2Q13367 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3B2Q13367 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3B2Q13367 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3B2Q13367 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AP3B2Q13367 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
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