Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDR1Q08345 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms