Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX4Q06945 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX4Q06945 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms