Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSTF1Q05048 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTF1Q05048 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms