Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUCB1Q02818 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NUCB1Q02818 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms