Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2BQ00403 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms