Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBX1P62877 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBX1P62877 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBX1P62877 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBX1P62877 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBX1P62877 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBX1P62877 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBX1P62877 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBX1P62877 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBX1P62877 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBX1P62877 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBX1P62877 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBX1P62877 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBX1P62877 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBX1P62877 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBX1P62877 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBX1P62877 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBX1P62877 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBX1P62877 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBX1P62877 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBX1P62877 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBX1P62877 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBX1P62877 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBX1P62877 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBX1P62877 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBX1P62877 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBX1P62877 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBX1P62877 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBX1P62877 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBX1P62877 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBX1P62877 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBX1P62877 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBX1P62877 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBX1P62877 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBX1P62877 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBX1P62877 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBX1P62877 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBX1P62877 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBX1P62877 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBX1P62877 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBX1P62877 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBX1P62877 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBX1P62877 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBX1P62877 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBX1P62877 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBX1P62877 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBX1P62877 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBX1P62877 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBX1P62877 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBX1P62877 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBX1P62877 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBX1P62877 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBX1P62877 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBX1P62877 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBX1P62877 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBX1P62877 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBX1P62877 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBX1P62877 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBX1P62877 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBX1P62877 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBX1P62877 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBX1P62877 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms