Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms