Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHBDL3P58872 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RHBDL3P58872 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms