Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLTPP55058 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLTPP55058 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLTPP55058 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLTPP55058 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLTPP55058 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLTPP55058 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLTPP55058 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLTPP55058 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLTPP55058 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLTPP55058 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLTPP55058 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLTPP55058 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLTPP55058 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLTPP55058 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLTPP55058 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PLTPP55058 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLTPP55058 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLTPP55058 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLTPP55058 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLTPP55058 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLTPP55058 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLTPP55058 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLTPP55058 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLTPP55058 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLTPP55058 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLTPP55058 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLTPP55058 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLTPP55058 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLTPP55058 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLTPP55058 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLTPP55058 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLTPP55058 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLTPP55058 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLTPP55058 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PLTPP55058 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLTPP55058 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLTPP55058 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLTPP55058 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLTPP55058 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLTPP55058 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLTPP55058 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PLTPP55058 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLTPP55058 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLTPP55058 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLTPP55058 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLTPP55058 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLTPP55058 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLTPP55058 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLTPP55058 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLTPP55058 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLTPP55058 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLTPP55058 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLTPP55058 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLTPP55058 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLTPP55058 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLTPP55058 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLTPP55058 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLTPP55058 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLTPP55058 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLTPP55058 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLTPP55058 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLTPP55058 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLTPP55058 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLTPP55058 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLTPP55058 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLTPP55058 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLTPP55058 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLTPP55058 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLTPP55058 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLTPP55058 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLTPP55058 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLTPP55058 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLTPP55058 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLTPP55058 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLTPP55058 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLTPP55058 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLTPP55058 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLTPP55058 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLTPP55058 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLTPP55058 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLTPP55058 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLTPP55058 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLTPP55058 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLTPP55058 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLTPP55058 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLTPP55058 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLTPP55058 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLTPP55058 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PLTPP55058 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PLTPP55058 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLTPP55058 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PLTPP55058 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLTPP55058 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLTPP55058 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLTPP55058 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLTPP55058 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLTPP55058 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLTPP55058 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLTPP55058 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms