Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMS2P54278 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMS2P54278 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PMS2P54278 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PMS2P54278 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMS2P54278 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMS2P54278 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMS2P54278 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMS2P54278 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P54278 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P54278 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P54278 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P54278 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P54278 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P54278 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P54278 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P54278 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P54278 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P54278 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P54278 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P54278 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P54278 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P54278 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P54278 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P54278 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P54278 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P54278 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P54278 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P54278 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P54278 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P54278 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P54278 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P54278 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P54278 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P54278 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P54278 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P54278 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P54278 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P54278 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P54278 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P54278 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P54278 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P54278 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P54278 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P54278 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P54278 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P54278 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P54278 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P54278 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P54278 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P54278 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P54278 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P54278 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P54278 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P54278 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P54278 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P54278 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P54278 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P54278 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P54278 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P54278 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P54278 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P54278 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P54278 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P54278 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P54278 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P54278 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P54278 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P54278 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P54278 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P54278 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P54278 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMS2P54278 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMS2P54278 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMS2P54278 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMS2P54278 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMS2P54278 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMS2P54278 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMS2P54278 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PMS2P54278 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PMS2P54278 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PMS2P54278 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P54278 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P54278 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P54278 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P54278 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P54278 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P54278 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P54278 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P54278 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P54278 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P54278 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P54278 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P54278 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P54278 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P54278 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P54278 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P54278 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P54278 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P54278 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms