Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2A2P52657 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2A2P52657 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms