Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CSNK1DP48730 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1DP48730 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms