Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms