Protein–RNA interactions for Protein: P48318

Gad1, Glutamate decarboxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gad1P48318 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gad1P48318 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gad1P48318 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gad1P48318 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gad1P48318 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gad1P48318 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gad1P48318 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gad1P48318 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gad1P48318 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms