Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ME1P48163 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ME1P48163 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ME1P48163 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ME1P48163 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ME1P48163 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ME1P48163 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ME1P48163 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ME1P48163 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ME1P48163 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ME1P48163 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ME1P48163 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ME1P48163 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ME1P48163 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME1P48163 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME1P48163 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME1P48163 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ME1P48163 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME1P48163 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME1P48163 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME1P48163 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ME1P48163 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME1P48163 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ME1P48163 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME1P48163 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME1P48163 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME1P48163 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ME1P48163 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ME1P48163 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME1P48163 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME1P48163 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME1P48163 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME1P48163 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME1P48163 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME1P48163 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME1P48163 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME1P48163 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME1P48163 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME1P48163 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME1P48163 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME1P48163 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME1P48163 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME1P48163 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME1P48163 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME1P48163 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME1P48163 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME1P48163 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME1P48163 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME1P48163 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME1P48163 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME1P48163 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME1P48163 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME1P48163 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME1P48163 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME1P48163 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME1P48163 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME1P48163 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ME1P48163 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME1P48163 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME1P48163 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME1P48163 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME1P48163 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME1P48163 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME1P48163 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME1P48163 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME1P48163 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME1P48163 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME1P48163 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME1P48163 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ME1P48163 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ME1P48163 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ME1P48163 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ME1P48163 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ME1P48163 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ME1P48163 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ME1P48163 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ME1P48163 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME1P48163 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME1P48163 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME1P48163 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME1P48163 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME1P48163 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME1P48163 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME1P48163 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME1P48163 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ME1P48163 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME1P48163 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ME1P48163 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME1P48163 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME1P48163 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME1P48163 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME1P48163 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME1P48163 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME1P48163 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME1P48163 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME1P48163 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME1P48163 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME1P48163 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME1P48163 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME1P48163 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms