Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 BOI2YER114C 3123 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 PHO12YHR215W 1404 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 PHO11YAR071W 1404 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 FAD1YDL045C 921 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 YEL028WYEL028W 462 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 SUP56tL(CAA)A 82 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 SUP53tL(CAA)C 82 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 SUP54tL(CAA)G2 82 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 YGR051CYGR051C 324 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 BNA1YJR025C 534 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 PRM9YAR031W 897 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 YPT53YNL093W 663 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 NRG2YBR066C 663 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 NTH1YDR001C 2256 nt4.07□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 DHH1YDL160C 1521 nt4.06□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 APE2YKL157W 2859 nt4.06□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 SSU1YPL092W 1377 nt4.06□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 DEG1YFL001W 1329 nt4.06□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 NOG1YPL093W 1944 nt4.06□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 COQ5YML110C 924 nt4.06□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 ASI2YNL159C 870 nt4.06□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 PFA4YOL003C 1137 nt4.06□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 TAF7YMR227C 1773 nt4.06□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 VPS36YLR417W 1701 nt4.06□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 BCH2YKR027W 2298 nt4.06□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 ERG5YMR015C 1617 nt4.06□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 SPO77YLR341W 1434 nt4.05□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 LTV1YKL143W 1392 nt4.05□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 RSC3YDR303C 2658 nt4.05□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 CLD1YGR110W 1338 nt4.05□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 TRS120YDR407C 3870 nt4.05□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 SPI1YER150W 447 nt4.05□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 SEC53YFL045C 765 nt4.05□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 AIR1YIL079C 1083 nt4.05□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 BAT2YJR148W 1131 nt4.05□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 ISA2YPR067W 558 nt4.05□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 YPR150WYPR150W 522 nt4.05□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 MSN4YKL062W 1893 nt4.05□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 FKH1YIL131C 1455 nt4.05□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 GCN5YGR252W 1320 nt4.04□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 IMG2YCR071C 441 nt4.04□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 YGL132WYGL132W 336 nt4.04□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 YGL262WYGL262W 528 nt4.04□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 ELF1YKL160W 438 nt4.04□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 ADD66YKL206C 804 nt4.04□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 YLL017WYLL017W 312 nt4.04□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 YLR374CYLR374C 390 nt4.04□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 YMR147WYMR147W 672 nt4.04□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 RNA14YMR061W 2034 nt4.04□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 YTM1YOR272W 1383 nt4.03□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 SLX8YER116C 825 nt4.03□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 GVP36YIL041W 981 nt4.03□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 SPT23YKL020C 3249 nt4.03□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 YOR022CYOR022C 2148 nt4.03□□□□□ -1.76
SHQ1P40486 TEL1YBL088C 8364 nt4.03□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 SPT6YGR116W 4356 nt4.02□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 YGL074CYGL074C 327 nt4.02□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 YGL188CYGL188C 174 nt4.02□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 SGN1YIR001C 753 nt4.02□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 PNG1YPL096W 1092 nt4.02□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt4.02□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 YDR271CYDR271C 372 nt4.01□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 OTU1YFL044C 906 nt4.01□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 HOS2YGL194C 1359 nt4.01□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 RAD54YGL163C 2697 nt4□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 SSM4YIL030C 3960 nt4□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 TRX3YCR083W 384 nt4□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 DSD1YGL196W 1287 nt4□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt4□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 MMM1YLL006W 1281 nt4□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 IDP2YLR174W 1239 nt4□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 SNO1YMR095C 675 nt4□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 IBD2YNL164C 1056 nt4□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 INA17YPL099C 549 nt4□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 COA2YPL189C-A 207 nt4□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 YBR134WYBR134W 402 nt4□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 ATG26YLR189C 3597 nt4□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 GAS2YLR343W 1668 nt4□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 YDR282CYDR282C 1245 nt3.99□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 YGR079WYGR079W 1113 nt3.99□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 OSH3YHR073W 2991 nt3.99□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 CDC8YJR057W 651 nt3.99□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 PCL10YGL134W 1302 nt3.98□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 CDC45YLR103C 1953 nt3.98□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 RPS13YDR064W 456 nt3.98□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 YGL193CYGL193C 312 nt3.98□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 VMA22YHR060W 546 nt3.98□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 DPH1YIL103W 1278 nt3.98□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 MRS3YJL133W 945 nt3.98□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 GMH1YKR030W 822 nt3.98□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 YLR156WYLR156W 345 nt3.98□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 YLR159WYLR159W 345 nt3.98□□□□□ -1.77
SHQ1P40486 YLR161WYLR161W 345 nt3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms