Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCKSP29966 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCKSP29966 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms