Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB5P28074 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB5P28074 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms