Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPN3P26045 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN3P26045 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms