Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT1P21579 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT1P21579 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT1P21579 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT1P21579 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT1P21579 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT1P21579 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT1P21579 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT1P21579 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYT1P21579 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYT1P21579 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYT1P21579 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYT1P21579 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT1P21579 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT1P21579 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT1P21579 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT1P21579 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT1P21579 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT1P21579 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT1P21579 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT1P21579 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT1P21579 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT1P21579 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT1P21579 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT1P21579 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT1P21579 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT1P21579 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT1P21579 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT1P21579 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT1P21579 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT1P21579 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT1P21579 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT1P21579 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT1P21579 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT1P21579 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT1P21579 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT1P21579 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT1P21579 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT1P21579 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT1P21579 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT1P21579 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT1P21579 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT1P21579 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT1P21579 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT1P21579 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT1P21579 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT1P21579 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT1P21579 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT1P21579 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT1P21579 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT1P21579 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT1P21579 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT1P21579 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT1P21579 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT1P21579 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT1P21579 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT1P21579 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT1P21579 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT1P21579 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT1P21579 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT1P21579 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT1P21579 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT1P21579 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT1P21579 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT1P21579 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT1P21579 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT1P21579 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT1P21579 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT1P21579 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT1P21579 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT1P21579 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT1P21579 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT1P21579 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT1P21579 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT1P21579 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT1P21579 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT1P21579 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT1P21579 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT1P21579 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT1P21579 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT1P21579 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT1P21579 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT1P21579 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT1P21579 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT1P21579 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT1P21579 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT1P21579 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT1P21579 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT1P21579 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT1P21579 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT1P21579 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT1P21579 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT1P21579 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT1P21579 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT1P21579 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT1P21579 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT1P21579 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT1P21579 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT1P21579 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT1P21579 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms