Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem254aP0DN89 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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