Protein–RNA interactions for Protein: P06400

RB1, Retinoblastoma-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1P06400 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RB1P06400 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RB1P06400 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RB1P06400 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RB1P06400 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RB1P06400 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RB1P06400 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RB1P06400 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RB1P06400 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RB1P06400 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RB1P06400 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RB1P06400 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RB1P06400 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RB1P06400 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RB1P06400 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RB1P06400 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RB1P06400 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RB1P06400 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RB1P06400 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RB1P06400 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RB1P06400 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RB1P06400 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RB1P06400 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RB1P06400 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RB1P06400 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RB1P06400 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RB1P06400 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RB1P06400 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RB1P06400 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RB1P06400 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RB1P06400 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RB1P06400 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RB1P06400 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RB1P06400 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RB1P06400 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RB1P06400 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RB1P06400 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RB1P06400 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RB1P06400 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RB1P06400 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RB1P06400 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RB1P06400 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RB1P06400 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RB1P06400 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RB1P06400 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RB1P06400 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RB1P06400 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RB1P06400 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RB1P06400 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RB1P06400 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RB1P06400 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RB1P06400 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RB1P06400 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RB1P06400 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RB1P06400 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RB1P06400 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RB1P06400 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RB1P06400 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RB1P06400 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RB1P06400 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RB1P06400 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RB1P06400 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RB1P06400 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RB1P06400 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RB1P06400 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RB1P06400 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RB1P06400 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RB1P06400 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RB1P06400 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RB1P06400 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RB1P06400 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RB1P06400 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RB1P06400 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RB1P06400 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RB1P06400 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RB1P06400 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RB1P06400 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RB1P06400 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RB1P06400 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RB1P06400 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RB1P06400 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RB1P06400 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RB1P06400 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RB1P06400 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RB1P06400 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RB1P06400 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RB1P06400 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RB1P06400 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RB1P06400 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RB1P06400 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RB1P06400 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RB1P06400 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RB1P06400 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RB1P06400 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RB1P06400 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RB1P06400 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RB1P06400 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RB1P06400 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RB1P06400 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RB1P06400 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms