Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20BO75063 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20BO75063 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms