Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NFKBIEO00221 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NFKBIEO00221 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFKBIEO00221 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms