Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
J3KR12 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3KR12 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
J3KR12 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3KR12 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
J3KR12 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3KR12 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3KR12 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3KR12 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3KR12 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3KR12 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
J3KR12 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
J3KR12 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3KR12 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3KR12 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3KR12 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3KR12 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3KR12 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3KR12 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3KR12 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3KR12 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3KR12 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3KR12 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3KR12 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3KR12 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
J3KR12 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3KR12 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
J3KR12 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
J3KR12 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3KR12 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3KR12 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3KR12 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3KR12 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3KR12 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3KR12 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3KR12 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3KR12 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3KR12 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3KR12 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3KR12 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
J3KR12 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3KR12 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3KR12 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3KR12 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3KR12 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3KR12 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3KR12 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3KR12 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
J3KR12 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
J3KR12 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
J3KR12 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
J3KR12 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KR12 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KR12 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KR12 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KR12 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KR12 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KR12 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KR12 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3KR12 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KR12 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KR12 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KR12 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KR12 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KR12 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KR12 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KR12 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KR12 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KR12 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KR12 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KR12 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KR12 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3KR12 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3KR12 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3KR12 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3KR12 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
J3KR12 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
J3KR12 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3KR12 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3KR12 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3KR12 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3KR12 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms