Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
B4E1Z4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
B4E1Z4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
B4E1Z4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
B4E1Z4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
B4E1Z4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
B4E1Z4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
B4E1Z4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
B4E1Z4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
B4E1Z4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
B4E1Z4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
B4E1Z4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
B4E1Z4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
B4E1Z4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
B4E1Z4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
B4E1Z4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
B4E1Z4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
B4E1Z4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
B4E1Z4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
B4E1Z4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
B4E1Z4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
B4E1Z4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
B4E1Z4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
B4E1Z4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
B4E1Z4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
B4E1Z4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
B4E1Z4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
B4E1Z4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
B4E1Z4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
B4E1Z4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
B4E1Z4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
B4E1Z4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
B4E1Z4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4E1Z4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4E1Z4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4E1Z4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4E1Z4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4E1Z4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4E1Z4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4E1Z4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4E1Z4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
B4E1Z4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4E1Z4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4E1Z4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4E1Z4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
B4E1Z4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
B4E1Z4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
B4E1Z4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
B4E1Z4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
B4E1Z4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
B4E1Z4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
B4E1Z4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
B4E1Z4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
B4E1Z4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
B4E1Z4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
B4E1Z4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
B4E1Z4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
B4E1Z4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
B4E1Z4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
B4E1Z4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
B4E1Z4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
B4E1Z4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
B4E1Z4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
B4E1Z4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
B4E1Z4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
B4E1Z4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
B4E1Z4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
B4E1Z4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
B4E1Z4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
B4E1Z4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
B4E1Z4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
B4E1Z4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
B4E1Z4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
B4E1Z4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
B4E1Z4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
B4E1Z4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
B4E1Z4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
B4E1Z4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
B4E1Z4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
B4E1Z4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
B4E1Z4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
B4E1Z4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
B4E1Z4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
B4E1Z4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
B4E1Z4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
B4E1Z4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
B4E1Z4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
B4E1Z4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
B4E1Z4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
B4E1Z4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
B4E1Z4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
B4E1Z4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
B4E1Z4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
B4E1Z4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
B4E1Z4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
B4E1Z4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4E1Z4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4E1Z4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4E1Z4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
B4E1Z4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms