Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMB4A4D0S4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms