Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SNHG14-218ENST00000553108 2208 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CTCFL-217ENST00000608425 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL121772.1-201ENST00000618303 2335 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC092117.2-201ENST00000623937 1659 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 RPH3A-201ENST00000389385 4679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MOB4-202ENST00000323303 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 NARF-201ENST00000309794 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MCF2L-202ENST00000375597 3413 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 FERMT1-204ENST00000536936 3229 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PMS2-201ENST00000265849 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SIRT5-204ENST00000397350 4382 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SRP68-212ENST00000602720 2037 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 NFASC-206ENST00000404076 5728 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 FOSB-202ENST00000417353 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MRPL22-207ENST00000523037 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 WDR62-201ENST00000270301 4632 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ECHDC1-209ENST00000454591 1515 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 NBPF1-204ENST00000432949 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AP5S1-205ENST00000615891 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CYP1A1-209ENST00000612821 2402 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ZNF766-202ENST00000593612 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 EIF2B2-201ENST00000266126 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC120024.4-201ENST00000624285 2143 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 KCNAB2-203ENST00000352527 4165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TMEM33-202ENST00000325094 6221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LRG1-201ENST00000306390 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RHCG-201ENST00000268122 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 NDUFAF7-202ENST00000336237 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PMEL-215ENST00000550464 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SLC18A1-201ENST00000265808 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MOV10-203ENST00000369645 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TYK2-202ENST00000524462 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC008966.1-201ENST00000502171 2367 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SLC25A19-210ENST00000580994 1554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC068669.1-201ENST00000623793 2228 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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