Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms