Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRG3Q9Y2Y8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRG3Q9Y2Y8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms