Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms