Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms