Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SHANK2Q9UPX8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHANK2Q9UPX8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms