Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EIF3KQ9UBQ5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EIF3KQ9UBQ5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EIF3KQ9UBQ5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EIF3KQ9UBQ5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EIF3KQ9UBQ5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EIF3KQ9UBQ5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EIF3KQ9UBQ5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EIF3KQ9UBQ5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EIF3KQ9UBQ5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms