Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNQ9P2M7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms