Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHD7Q9P2D1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHD7Q9P2D1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms