Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PHRF1Q9P1Y6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHRF1Q9P1Y6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms