Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDND1Q9NY35 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDND1Q9NY35 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms