Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUA8

ZBTB40, Zinc finger and BTB domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB40Q9NUA8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBTB40Q9NUA8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBTB40Q9NUA8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBTB40Q9NUA8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBTB40Q9NUA8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBTB40Q9NUA8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBTB40Q9NUA8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBTB40Q9NUA8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms