Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4m1Q9JKC7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms