Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD248Q9HCU0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD248Q9HCU0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms