Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNCQ9H7C4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNCQ9H7C4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms