Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN3Q9H3W5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRN3Q9H3W5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRN3Q9H3W5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN3Q9H3W5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN3Q9H3W5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN3Q9H3W5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN3Q9H3W5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN3Q9H3W5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN3Q9H3W5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN3Q9H3W5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN3Q9H3W5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN3Q9H3W5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN3Q9H3W5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN3Q9H3W5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN3Q9H3W5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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