Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CRC3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CRC3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CRC3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRC3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRC3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRC3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRC3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRC3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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